Năm 1969, cuộc kháng chiến chống Mỹ cứu nước của nhân dân Việt Nam bước vào thời kỳ ác liệt nhất, Đế quốc Mỹ tiến hành ném bom, bắn phá nhằm hủy diệt miền Bắc xã hội chủ nghĩa. Mặc dù vừa phải đánh trả không quân Mỹ bảo vệ Hà Nội, bảo vệ miền Bắc, vừa tiếp tục tập trung sức người, sức của để chi viện cho chiến trường miền Nam; Đảng và Chính phủ vẫn luôn quan tâm đến việc chăm lo sức khỏe cho nhân dân nói chung và đồng bào dân tộc nói riêng. Trước tình hình bệnh bướu cổ phổ biến ở các tỉnh miền núi phía Bắc, Chính phủ, Bộ Y tế đã quyết định thành lập Bệnh viện Nội tiết nhằm thực hiện các hoạt động phòng chống bệnh bướu cổ, bảo vệ sức khỏe nhân dân.

Thành lập trong giai đoạn ác liệt của chiến tranh, điều kiện kinh tế, xã hội còn hết sức khó khăn, thiếu thốn, nên Bệnh viện gặp rất nhiều khó khăn để triển khai hoạt động. Nhân lực Bệnh viện ban đầu chỉ gồm 5-7 cán bộ được Bộ Y tế điều chuyển về Bệnh viện.

Thời kỳ đầu Bệnh viện Nội tiết tập trung các hoạt động phòng chống bệnh bướu cổ khu vực miền núi phía Bắc. Năm 1995, Chương trình Quốc gia Phòng chống các rối loạn thiếu I ốt được thành lập. Bệnh viện Nội tiết là đầu mối chịu trách nhiệm triển khai các hoạt động phòng chống các rối loạn thiếu I ốt (CRLTI) trên phạm vi toàn quốc.

Dưới sự chỉ đạo của Chính phủ, Bộ Y tế và sự giúp đỡ của các Tổ chức quốc tế như UNICEF, ICCIDD, CEMUBAC, AUSAID, Chương trình Quốc gia Phòng chống các rối loạn thiếu I ốt đã hoàn thành việc thanh toán tình trạng thiếu I ốt tại Việt Nam. Thành công này được các Tổ chức quốc tế đánh giá cao.

Cuối những năm 90, đầu năm 2000, cùng với sự phát triển mạnh mẽ của kinh tế xã hội thời kỳ đổi mới, mô hình bệnh tật đã bắt đầu có sự thay đổi, các bệnh không lây nhiễm trong đó có các bệnh chuyển hóa như đái tháo đường, béo phì, rối loạn chuyển hóa lipid... gia tăng. Trước tình hình đó, được sự quan tâm chỉ đạo của Bộ Y tế, Đảng ủy, Ban Giám đốc đã xác định rõ hai nhiệm vụ cơ bản của Bệnh viện đó là Phòng bệnh và Chữa bệnh. Bệnh viện đã kiện toàn lại tổ chức, nhân sự, thành lập thêm các khoa/phòng mới, tăng cường đào tạo nhân lực nhằm thực hiện các hoạt động phòng chống CRLTI trên toàn quốc, cũng như tăng cường công tác khám, điều trị bệnh nội tiết và chuyển hóa đáp ứng nhu cầu điều trị của nhân dân.

Trải qua 53 năm xây dựng và trưởng thành, vượt qua những khó khăn, thách thức cùng với sự trăn trở đổi mới đi lên để đáp ứng nhu cầu khám chữa bệnh cho nhân dân của đội ngũ thầy thuốc và nhân viên y tế; sự quan tâm của Đảng, Nhà nước, đến nay, Bệnh viện đã đạt được nhiều thành tựu quan trọng trên các lĩnh vực.

Bệnh viện đã xây dựng cơ sở vật chất hiện đại với 2 cơ sở khám, chữa bệnh khang trang, tập trung nhiều chuyên gia có trình độ chuyên môn cao. Từ chỗ số lượng khám bệnh 400-500 bệnh nhân ngoại trú/ngày, hiện nay số bệnh nhân ngoại trú cả 2 cơ sở đã tăng lên trên 2000 người/ngày.

Trong những qua, Bệnh viện đã nghiên cứu thành công nhiều đề tài khoa học có giá trị cao, điển hình là đề tài cấp nhà nước “Nghiên cứu ứng dụng phẫu thuật nội soi tuyến giáp trong điều trị một số Bệnh lý tuyến giáp” do PGS Trần Ngọc Lương(2014) thực hiện. Bệnh viên còn là cơ sở thực hành cho các sinh viên của các trường y dược, tập huấn, giảng dạy cho hàng trăm bác sỹ, điều dưỡng, kỹ thuật viên đại học, sau đại học và các đơn vị cơ sở y tế tuyến dưới. Bệnh viện đã chủ động và có nhiều hoạt động hợp tác quốc tế hiệu quả, tiếp cận với trình độ chuyên môn, kỹ thuật cao, tiên tiến của thế giới. Một số kỹ thuật mới tiên tiến khác như: Phẫu thuật nội soi tuyến giáp, điều trị tuyến giáp bằng sóng cao tần, triển khai điều trị I ốt 131 trong điều trị ung thư tuyến giáp sau phẫu thuật; lọc máu (thận nhân tạo); chụp CT, PET CT … Đặc biệt, Bệnh viện là cơ sở y tế đầu tiên và duy nhất trên cả nước đưa vào triển khai hoạt động chuyên ngành Chăm sóc bàn chân và tổn thương trên người Bệnh đái tháo đường; áp dụng các thủ thuật, phương pháp điều trị liền thương tiên tiến nhằm hỗ trợ điều trị loét bàn chân; phục hồi chức năng bàn chân, hạn chế mức thấp nhất việc phải cắt cụt chi, rút ngắn thời gian nằm viện cho người Bệnh.

Đồng thời Bệnh viện được Bộ Y tế giao chỉ đạo và thực hiện Dự án Phòng chống đái tháo đường và Phòng chống CRLTI thuộc Chương trình Mục tiêu Y tế Dân số giai đoạn 2016-2020 theo Quyết định 1125/QĐ-TTg của Thủ tướng Chính phủ ngày 31 tháng 7 năm 2017. Bệnh viện thực hiện chỉ đạo chuyên môn 63 đơn vị thuộc Hệ thống Nội tiết – Chuyển hóa trên toàn quốc.

Từ năm 2008 đến nay, Bệnh viện cũng đã tiến hành chuyển giao các gói kỹ thuật, hỗ trợ nâng cao chuyên môn kỹ thuật trong lĩnh vực nội tiết chuyển hóa cho nhiều Bệnh viện đa khoa tỉnh, Bệnh viện nội tiết tỉnh khu vực phía Bắc theo đề án 1816, đề án Khám chữa bệnh từ xa.

Bệnh viện không chỉ xây dựng hình ảnh giỏi về chuyên môn mà còn rất tích cực tham gia các vào các hoạt động xã hội, hướng tới cộng đồng, hỗ trợ người nghèo, trẻ em, đồng bào vùng sâu, vùng xa thông qua việc xây dựng nhà tình nghĩa, công trình vệ sinh, nhà ăn…

Với sự nỗ lực không ngừng nghỉ, trong suốt 53 xây dựng và phát triển, Bệnh viện đã đạt được nhiều thành tích to lớn của ngành. Có thể kể đến việc nhiều năm liên tục được nhận Bằng khen của Bộ trưởng Bộ Y tế, được tặng danh hiệu Tập thể Lao động xuất sắc. Và đặc biệt hơn cả, năm 2019, nhân dịp kỷ niệm 50 năm thành lập, Bệnh viện đã vinh dự được Đảng và Nhà nước trao tặng Huân chương lao động hạng Nhất, đây được xem là bước đánh dấu quan trọng ghi nhận những công sức và nỗ lực hết mình của tập thể các nhân viên y tế, người lao động Bệnh viện Nội tiết Trung ương.

Nhân dịp kỷ niệm 53 năm thành lập (16/09/1969-16/09/2022), Bệnh viện Nội tiết Trung ương mong muốn sẽ tiếp tục nhận được sự quan tâm của Đảng, Nhà nước, Bộ Y tế cùng các cơ quan, Ban Ngành... và đặc biệt là sự ủng hộ của người bệnh. Sự tin yêu, đồng hành của người bệnh sẽ là động lực để mỗi viên chức, người lao động tiếp tục nhiệt huyết, cống hiến trong công tác chăm sóc và bảo vệ sức khỏe cho nhân dân đúng với phương châm TẤT CẢ VÌ SỰ HÀI LÒNG CỦA NGƯỜI BỆNH.