Bệnh viện Nội tiết Trung ương hoạt động tại 2 cơ sở: Cơ sở Tứ Hiệp và cơ sở Thái Thịnh.
- Lãnh đạo Bệnh viện: 1 Giám đốc, 3 phó giám đốc
- Các khoa phòng: Bao gồm
19 khoa lâm sàng.
05 khoa cận lâm sàng
17 phòng chức năng
01 Ban quản lý dự án
- Tổng số cán bộ: 1044 người
Biên chế: 878 người
Hợp đồng 68: 135 người
Hợp đồng có thời hạn: 31 người
Cán bộ có trình độ trên đại học: 94 người.
Đaị học: 618 người
Cao đẳng: 75 người
Trung cấp: 390 người (kể cả đang học liên thông)
Lao động khác: 133 người