Bệnh viện Nội tiết Trung ương hoạt động tại 2 cơ sở: Cơ sở Tứ Hiệp và cơ sở Thái Thịnh.

• Lãnh đạo Bệnh viện: 1 Giám đốc, 3 phó giám đốc
• Các khoa phòng: Bao gồm

                                     19 khoa lâm sàng.

                                     05 khoa cận lâm sàng

                                     17 phòng chức năng

                                     01 Ban quản lý dự án

• Tổng số cán bộ: 1044 người

                                      Biên chế: 878 người

                                      Hợp đồng 68: 135 người

                                      Hợp đồng có thời hạn: 31 người

Cán bộ có trình độ trên đại học: 94 người.

         Đaị học: 618 người

         Cao đẳng: 75 người

         Trung cấp: 390 người (kể cả đang học liên thông)

          Lao động khác: 133 người